W latach 1605-1608 Flaminio Ponzio wzniósł dla kanoników Bazyliki pałac, którego dolne piętro mieściło w okresie zimowym nową zakrystię i chór. Sklepienie chóru zostało ozdobione przez Passignano (1608-10) freskami przedstawiającymi Ojców Kościoła i proroków, którzy otaczają Maryję. Marmurowa płaskorzeźba ze sceną Wniebowzięcia Matki Bożej jest dziełem Pietro Berniniego (1608-10), ojca słynnego Gian Lorenzo Bernini.
Podczas pontyfikatu Leona XII (1823-29) Giuseppe Valadier przekształcił chór zimowy w baptysterium. Specjalnie na potrzeby tego nowego pomieszczenia, papież ofiarował chrzcielnicę z czerwonego porfiru, otoczoną marmurową balustradą.
W 867 r. w Bazylice Santa Maria Maggiore papież Hadrian II przyjął świętych Cyryla i Metodego. Wtedy też zatwierdził używanie języka starosłowiańskiego w liturgii. W baptysterium to historyczne wydarzenie upamiętniają okolicznościowe tablice umieszczone tam przez ludy słowiańskojęzyczne.